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PEARマニュアル
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インラインのコメントブロック (docblocks) を必ず表記します。 PEAR パッケージに対するコメントブロックの表記方法については、 サンプルファイル および ヘッダコメントブロック のセクションを参照してください。 詳細な情報は、 http://www.phpdoc.org/ にあります。
インラインドキュメント以外のコメントを書くことも推奨します。一般的な目安として、 コードのある部分を見て「言葉だけで説明したくないな」と思うような場合には、 処理内容を忘れてしまう前にコメントを追加する必要があります。
C 言語形式 (/* */) と標準 C++ コメント (//) のどちらも使用可能です。 Perl/shell 形式のコメント (#) は使用するべきではありません。
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SQLインジェクション対策は時と場合で使う関数が変わります。その時にあったものを使いましょう。